PLACIS

PLAteforme de Calcul Intensif et de Stockage

La plupart des développements méthodologiques dans les domaines du traitement de l’information médicale nécessitent des essais de validation basés majoritairement sur des données simulées ou des bases de données intégrant des connaissances à priori. La création de ces bases de données simulées et les études de validation associées sont des processus lents nécessitant des temps de calcul très longs. Afin de faciliter ces travaux de validation indispensables pour les différents axes du laboratoire, une plateforme de calcul intensif et de simulation a été mise en place. Cette plateforme consiste en deux volets, l'un matériel et l'autre logiciel.

Le volet matériel est un cluster hybride doté de 800 coeurs CPU et de 72 GPU dédiés aux calculs, quant aux capacités de stockage elles atteignent environ 200To utiles.

Le volet logiciel concerne principalement les méthodes de Monte Carlo (MC) qui sont devenues incontournables pour de nombreuses applications médicales, en particulier en imagerie et en radiothérapie. Tout particulièrement, notre équipe participe au développement et à la validation d'un ensemble de logiciels autour de la simulation MC (www.opengatecollaboration.org) et de la reconstruction.

Un autre projet concerne la conception d’un logiciel de modélisation permettant la combinaison de modèles informatiques tissulaires (par exemple les tumeurs) avec les modèles anthropomorphiques spécifiques aux patients. Ce projet qui représente un axe transversal de recherche entre les deux unités INSERM U1101 et U1078, mais dans l’avenir également de EA3883 UBO - ENIB (LISyC), devrait permettre au PLACIS de devenir une plateforme de modélisation de l’Institut Brestois de Santé Agro Matière (IBSAM). Il est important de souligner que cette plateforme de calcul intensif mise en place grâce au financement obtenu au sein de l’axe vectorisation tumorale du Cancéropôle Grand Ouest (CGO) est déjà reconnue en tant que «plateforme technologique de simulation en imagerie et dosimétrie» par le CGO.

Il faut noter qu'en 2017 la plateforme à reçue une mise à jour importante grâce au projet de recherche "PreClinLab" dans le cadre du C.P.E.R 2015-2020.